2003年9月，根据党中央、国务院统一部署，湖北省政府印发《省人民政府关于组建省政府采购中心、省招标中心的通知》(鄂政发〔2003〕39号)，分别组建了湖北省政府采购中心、湖北省综合招投标中心。

2008年9月，湖北省编办印发《关于将建设工程招投标交易管理中心并入省综合招投标中心的通知》(鄂编办发〔2008〕62号)，将省建设工程招投标交易管理中心整建制并入省综合招投标中心。

2012年10月，经湖北省编委批复，湖北省综合招投标中心正式更名为湖北省公共资源交易中心。

2011年9月，湖北省编办印发《关于设立湖北省基本药物采购中心的批复》(鄂编办文〔2011〕95号)，设立湖北省基本药物采购中心并加挂湖北省卫生管理服务中心牌子。

2018年11月，湖北省委、湖北省政府印发《中共湖北省委、湖北省人民政府关于湖北省省级机构改革的实施意见》(鄂发〔2018〕31号)，决定将湖北省政府采购中心、湖北省公共资源交易中心、湖北省基本药物采购中心的职责整合，重新设立湖北省公共资源交易中心(湖北省政府采购中心)，为湖北省政府直属正厅级事业单位。

2020年1月，湖北省公共资源交易中心(湖北省政府采购中心)正式挂牌成立。